تدور احداث قصة الفيلم (فيلم الرجل إكس 2) الجزء الثانى في إطار من الاكشن والمغامرات تدور اﻷحداث حول (الرجل إكس) الذى تم تحريرة من سجنه في الغرفة البلاستيكية التي تبدو أنها قوية، و الذي أودع فيه بعد هزيمته من قوات سترايكر، حيث تبدأ أحداث اﻹثارة، عندما تذهب كائنات متحولة الى البيض اﻷبيض ليلا لكى تقوم بأغتيال الرئيس، فتقوم الحكومه باتخاذ الاجرأت اللازمة فى ذالك الامر، وبالتزامن مع تلك اﻷحداث تحاول (ميغان) اكتشاف ماضيه من خلال عالم يدعى (ويليام سترايكر)، الذي يكتشف سر (إكس) وغموضه، ومع تتابع اﻷحداث تحاول (ميستيك) ان تقوم بتحرير ماجنيتو من السجن، ولكن عند هجوم مدرسة البروفيسور (إكس) من قوات سترايكر ينجح عدد من الطلاب في الهروب، وتقوم الطلاب بالاتحاد الهاربون مع ماجنيتو لتحرير الرجل إكس.